Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHLRC3Q5JS37 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHLRC3Q5JS37 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.6 ms