Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROX2Q3B8N5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROX2Q3B8N5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms