Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HNF4GQ14541 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HNF4GQ14541 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms