Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF9Q13886 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms