Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAPC2Q13487 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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