Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 EPS8L2-207ENST00000526651 572 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.344e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.764e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.784e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.184e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-210ENST00000433417 940 ntTSL 215.09■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-215ENST00000471478 991 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-204ENST00000376666 2100 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-213ENST00000447877 932 ntTSL 511.71□□□□□ -0.532e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-217ENST00000485936 2588 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 ENTPD6-216ENST00000481322 414 ntTSL 37.87□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 214.21□□□□□ -0.142e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 213.81□□□□□ -0.22e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 PCM1-204ENST00000517730 2536 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.541e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-217ENST00000492998 745 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 RXRB-203ENST00000481441 1330 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-220ENST00000505849 1503 ntTSL 210.38□□□□□ -0.752e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-214ENST00000482365 2620 ntTSL 29.84□□□□□ -0.832e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-211ENST00000480479 2792 ntTSL 29.29□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-212ENST00000480646 614 ntTSL 38.76□□□□□ -1.012e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-208ENST00000469113 707 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.072e-8■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.291e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 PCM1-205ENST00000517836 580 ntTSL 34.15□□□□□ -1.751e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.041e-7■□□□□ 10.6
SRSF9Q13242 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.087e-8■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 515.05■□□□□ 04e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.054e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 FBXO31-203ENST00000563956 548 ntTSL 314.39□□□□□ -0.114e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 513.57□□□□□ -0.244e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.527e-8■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.974e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 57.46□□□□□ -1.224e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 FBXO31-206ENST00000569412 431 ntTSL 53.04□□□□□ -1.924e-10■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.268e-7■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 214.53□□□□□ -0.083e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.323e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.543e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-211ENST00000519531 1490 ntTSL 311.03□□□□□ -0.643e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 59.89□□□□□ -0.833e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 59.38□□□□□ -0.913e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 48.69□□□□□ -1.023e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 58.25□□□□□ -1.093e-12■□□□□ 10.4
SRSF9Q13242 JMJD7-PLA2G4B-205ENST00000490848 7218 ntTSL 212.74□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 JMJD7-PLA2G4B-206ENST00000491746 7227 ntTSL 210.73□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 JMJD7-PLA2G4B-203ENST00000476036 577 ntTSL 59.86□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.944e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.974e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 JMJD7-PLA2G4B-204ENST00000487292 3178 ntTSL 28.68□□□□□ -1.024e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 CROCCP2-203ENST00000635081 1904 ntTSL 514.49□□□□□ -0.098e-9■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.218e-9■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 513.33□□□□□ -0.288e-9■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 CROCCP2-207ENST00000640476 1750 ntTSL 513.25□□□□□ -0.298e-9■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.53□□□□□ -0.48e-9■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.58e-9■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 COL27A1-204ENST00000477421 3991 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 59.97□□□□□ -0.812e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 48.01□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 ACIN1-221ENST00000557432 642 ntTSL 37.84□□□□□ -1.157e-14■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 ACIN1-208ENST00000553721 610 ntTSL 36.58□□□□□ -1.367e-14■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.755e-7■□□□□ 10.3
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 26.51□□□□□ -1.373e-12■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-208ENST00000528475 2067 ntTSL 217.33■□□□□ 0.371e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-211ENST00000531184 2213 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 515.48■□□□□ 0.071e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-207ENST00000526469 1643 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 214.91□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-216ENST00000592123 935 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-216ENST00000534602 480 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.2
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