Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTP4A2Q12974 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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