Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP54P61011 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP54P61011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP54P61011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP54P61011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRP54P61011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP54P61011 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP54P61011 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP54P61011 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP54P61011 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP54P61011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms