Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMB2P55268 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB2P55268 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms