Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms