Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms