Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00271P0C7V0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms