Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TK1P04183 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TK1P04183 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TK1P04183 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TK1P04183 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TK1P04183 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TK1P04183 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TK1P04183 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TK1P04183 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TK1P04183 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TK1P04183 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TK1P04183 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.3 ms