Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN7L1Q9ULK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN7L1Q9ULK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms