Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNIKQ9UKE5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
TNIKQ9UKE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNIKQ9UKE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms