Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPUSD1Q9UJJ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms