Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCN11AQ9UI33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN11AQ9UI33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN11AQ9UI33 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms