Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC17Q9NVM6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms