Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA3Q9NST1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms