Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SARS2Q9NP81 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SARS2Q9NP81 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms