Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBF4Q9BQW3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms