Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC45A3Q96JT2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC45A3Q96JT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms