Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STAG3L4Q8TBR4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms