Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD7Q8N8D1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD7Q8N8D1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms