Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNE4Q8N205 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNE4Q8N205 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNE4Q8N205 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms