Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM139Q8IV31 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms