Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC11Q7Z392 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC11Q7Z392 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms