Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms