Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK5Q00535 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms