Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP107P57740 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP107P57740 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP107P57740 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP107P57740 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP107P57740 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP107P57740 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP107P57740 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP107P57740 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms