Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC3P53804 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC3P53804 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC3P53804 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC3P53804 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC3P53804 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC3P53804 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC3P53804 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC3P53804 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms