Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA3P35244 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA3P35244 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA3P35244 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA3P35244 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA3P35244 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPA3P35244 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPA3P35244 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPA3P35244 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPA3P35244 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA3P35244 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA3P35244 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPA3P35244 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPA3P35244 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms