Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXP28300 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXP28300 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXP28300 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXP28300 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXP28300 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXP28300 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXP28300 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXP28300 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXP28300 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms