Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00271P0C7V0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00271P0C7V0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms