Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPM3P06753 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM3P06753 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM3P06753 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM3P06753 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM3P06753 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM3P06753 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM3P06753 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM3P06753 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM3P06753 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM3P06753 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM3P06753 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms