Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5LO95447 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5LO95447 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms