Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD4O95243 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD4O95243 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD4O95243 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD4O95243 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MBD4O95243 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD4O95243 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD4O95243 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD4O95243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD4O95243 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD4O95243 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MBD4O95243 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MBD4O95243 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD4O95243 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD4O95243 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD4O95243 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD4O95243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD4O95243 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD4O95243 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD4O95243 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD4O95243 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD4O95243 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD4O95243 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD4O95243 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD4O95243 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD4O95243 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MBD4O95243 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MBD4O95243 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MBD4O95243 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms