Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
SPAG9O60271 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SPAG9O60271 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SPAG9O60271 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SPAG9O60271 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SPAG9O60271 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPAG9O60271 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SPAG9O60271 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SPAG9O60271 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPAG9O60271 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPAG9O60271 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPAG9O60271 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms