Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO3A2RU48 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMCO3A2RU48 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms