Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
C1QTNF1Q9BXJ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1QTNF1Q9BXJ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C1QTNF1Q9BXJ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
C1QTNF1Q9BXJ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1QTNF1Q9BXJ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C1QTNF1Q9BXJ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C1QTNF1Q9BXJ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C1QTNF1Q9BXJ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms