Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC22D3Q99576 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC22D3Q99576 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC22D3Q99576 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC22D3Q99576 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC22D3Q99576 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC22D3Q99576 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC22D3Q99576 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC22D3Q99576 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC22D3Q99576 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC22D3Q99576 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC22D3Q99576 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC22D3Q99576 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC22D3Q99576 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC22D3Q99576 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSC22D3Q99576 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSC22D3Q99576 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC22D3Q99576 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC22D3Q99576 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSC22D3Q99576 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC22D3Q99576 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSC22D3Q99576 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC22D3Q99576 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSC22D3Q99576 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC22D3Q99576 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSC22D3Q99576 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSC22D3Q99576 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSC22D3Q99576 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms