Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT12Q8IV01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT12Q8IV01 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT12Q8IV01 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SYT12Q8IV01 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT12Q8IV01 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT12Q8IV01 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT12Q8IV01 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT12Q8IV01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT12Q8IV01 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT12Q8IV01 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT12Q8IV01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYT12Q8IV01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYT12Q8IV01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYT12Q8IV01 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYT12Q8IV01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYT12Q8IV01 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYT12Q8IV01 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYT12Q8IV01 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms