Protein–RNA interactions for Protein: Q86XP3

DDX42, ATP-dependent RNA helicase DDX42, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX42Q86XP3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.5
DDX42Q86XP3 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 28.5
DDX42Q86XP3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 LINC00910-205ENST00000592094 1042 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 LINC00910-204ENST00000588654 541 ntTSL 412.74□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.12e-9■■■■■ 27.9
DDX42Q86XP3 MKRN1-214ENST00000495305 1390 ntTSL 229.73■■■□□ 2.356e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-212ENST00000481705 636 ntTSL 527.56■■■□□ 26e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-216ENST00000498535 607 ntTSL 226.98■■□□□ 1.916e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.856e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.76e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-215ENST00000496169 1625 ntTSL 224.52■■□□□ 1.526e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.986e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.866e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 220.42■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 319.55■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 519.5■□□□□ 0.716e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-206ENST00000471104 1053 ntTSL 519.45■□□□□ 0.76e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 BTNL9-206ENST00000511056 332 ntTSL 319.33■□□□□ 0.686e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 218.99■□□□□ 0.636e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.626e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-252ENST00000637821 2026 ntTSL 518.76■□□□□ 0.596e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-240ENST00000636871 2076 ntTSL 518.62■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-208ENST00000636461 5083 ntTSL 518.61■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-251ENST00000637684 2168 ntTSL 518.59■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-238ENST00000636803 1945 ntTSL 518.57■□□□□ 0.566e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-254ENST00000637982 2330 ntTSL 518.37■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 518.27■□□□□ 0.526e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 BTNL9-203ENST00000491209 2199 ntTSL 218.15■□□□□ 0.56e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 418.11■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 518■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-234ENST00000636587 2040 ntTSL 517.98■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-225ENST00000635889 2260 ntTSL 517.97■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-227ENST00000635936 2223 ntTSL 517.65■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-244ENST00000637114 1991 ntTSL 517.24■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-255ENST00000637994 2468 ntTSL 517.24■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-257ENST00000638092 2448 ntTSL 517.12■□□□□ 0.336e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 217.04■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-229ENST00000636070 1827 ntTSL 217.03■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 216.97■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.286e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-212ENST00000476226 2379 ntTSL 516.66■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-246ENST00000637291 2662 ntTSL 516.64■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-241ENST00000636978 1613 ntTSL 516.45■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-222ENST00000635772 2768 ntTSL 516.42■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 BTNL9-208ENST00000512570 885 ntTSL 516.36■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-214ENST00000478594 2110 ntTSL 516.35■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.26e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.186e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.186e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.186e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-248ENST00000637457 2815 ntTSL 516.09■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-205ENST00000430521 798 ntTSL 516.02■□□□□ 0.166e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-203ENST00000399379 977 ntTSL 515.84■□□□□ 0.136e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-237ENST00000636725 2677 ntTSL 515.27■□□□□ 0.036e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.016e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-228ENST00000636023 1780 ntTSL 515.06■□□□□ 06e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-220ENST00000498571 619 ntTSL 215.04■□□□□ -06e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-209ENST00000485108 596 ntTSL 515.04■□□□□ -06e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.016e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-242ENST00000636991 2403 ntTSL 514.89□□□□□ -0.036e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.036e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MKRN1-209ENST00000475010 3467 ntTSL 214.82□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MARCH6-203ENST00000502795 580 ntTSL 414.62□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.086e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-215ENST00000480957 3243 ntTSL 414.39□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-245ENST00000637268 2855 ntTSL 514.38□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-202ENST00000636204 3240 ntTSL 513.93□□□□□ -0.186e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-218ENST00000493046 3504 ntTSL 513.81□□□□□ -0.26e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AKNA-207ENST00000490767 535 ntTSL 313.73□□□□□ -0.216e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-206ENST00000637088 6740 ntTSL 513.58□□□□□ -0.246e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-208ENST00000462048 546 ntTSL 413.49□□□□□ -0.256e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-219ENST00000495436 843 ntTSL 213.34□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-216ENST00000487589 811 ntTSL 513.32□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-217ENST00000491800 3780 nt13.2□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-204ENST00000637442 4178 ntTSL 513.06□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AC104452.1-205ENST00000638079 3146 ntTSL 513□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 MARCH6-209ENST00000510872 577 ntTSL 412.99□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-210ENST00000473163 4544 ntTSL 212.93□□□□□ -0.346e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 AMT-253ENST00000637914 3677 ntTSL 512.89□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 BTNL9-204ENST00000506782 676 ntTSL 512.59□□□□□ -0.396e-6■■■■■ 27.6
DDX42Q86XP3 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.46e-6■■■■■ 27.6
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