Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP350Q5VT06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CEP350Q5VT06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CEP350Q5VT06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP350Q5VT06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP350Q5VT06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP350Q5VT06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP350Q5VT06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP350Q5VT06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP350Q5VT06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP350Q5VT06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP350Q5VT06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP350Q5VT06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP350Q5VT06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP350Q5VT06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CEP350Q5VT06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP350Q5VT06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CEP350Q5VT06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP350Q5VT06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP350Q5VT06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CEP350Q5VT06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CEP350Q5VT06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CEP350Q5VT06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CEP350Q5VT06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP350Q5VT06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CEP350Q5VT06 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP350Q5VT06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CEP350Q5VT06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CEP350Q5VT06 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CEP350Q5VT06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CEP350Q5VT06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CEP350Q5VT06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CEP350Q5VT06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CEP350Q5VT06 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CEP350Q5VT06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CEP350Q5VT06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CEP350Q5VT06 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP350Q5VT06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP350Q5VT06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CEP350Q5VT06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CEP350Q5VT06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP350Q5VT06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CEP350Q5VT06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP350Q5VT06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CEP350Q5VT06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CEP350Q5VT06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CEP350Q5VT06 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CEP350Q5VT06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CEP350Q5VT06 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CEP350Q5VT06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP350Q5VT06 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP350Q5VT06 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP350Q5VT06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP350Q5VT06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP350Q5VT06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CEP350Q5VT06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CEP350Q5VT06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CEP350Q5VT06 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms