Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO43Q4G163 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FBXO43Q4G163 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO43Q4G163 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO43Q4G163 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO43Q4G163 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO43Q4G163 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO43Q4G163 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO43Q4G163 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO43Q4G163 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO43Q4G163 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO43Q4G163 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO43Q4G163 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO43Q4G163 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO43Q4G163 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO43Q4G163 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO43Q4G163 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO43Q4G163 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO43Q4G163 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXO43Q4G163 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FBXO43Q4G163 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO43Q4G163 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO43Q4G163 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO43Q4G163 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO43Q4G163 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO43Q4G163 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms