Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 64.3
PCBP1Q15365 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 64.3
PCBP1Q15365 DOT1L-202ENST00000446286 376 ntTSL 318.14■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 64.2
PCBP1Q15365 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 321.33■■□□□ 15e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.975e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.535e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-10■■■■■ 63.4
PCBP1Q15365 CTDNEP1-205ENST00000570828 986 ntTSL 313.75□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 62.4
PCBP1Q15365 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-17■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-17■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 HAMP-202ENST00000593580 2624 nt12.92□□□□□ -0.344e-9■■■■■ 62.3
PCBP1Q15365 SNX17-203ENST00000440760 1955 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.884e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-202ENST00000427123 2007 ntTSL 220.15■□□□□ 0.824e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.814e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.534e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 SNX17-204ENST00000453453 1638 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.334e-22■■■■■ 62.2
PCBP1Q15365 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 62
PCBP1Q15365 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 62
PCBP1Q15365 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 61.7
PCBP1Q15365 MLLT1-203ENST00000587473 556 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 61.7
PCBP1Q15365 C9orf16-204ENST00000492588 1570 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 61.5
PCBP1Q15365 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 61.5
PCBP1Q15365 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-27■■■■■ 61
PCBP1Q15365 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-27■■■■■ 61
PCBP1Q15365 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-27■■■■■ 61
PCBP1Q15365 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-43■■■■■ 60.9
PCBP1Q15365 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-43■■■■■ 60.9
PCBP1Q15365 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 210.85□□□□□ -0.673e-43■■■■■ 60.9
PCBP1Q15365 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 60.6
PCBP1Q15365 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 417.8■□□□□ 0.444e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 516.64■□□□□ 0.254e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 215.53■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.4■□□□□ 0.064e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 514.16□□□□□ -0.144e-10■■■■■ 60.4
PCBP1Q15365 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.566e-9■■■■■ 60.1
PCBP1Q15365 NAPA-215ENST00000597271 1467 ntTSL 220.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 60
PCBP1Q15365 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 60
PCBP1Q15365 NAPA-207ENST00000594217 554 ntTSL 510.63□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 60
PCBP1Q15365 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 59.6
PCBP1Q15365 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 59.6
PCBP1Q15365 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 29.86□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 59.5
PCBP1Q15365 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.082e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 225.22■■□□□ 1.632e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AMN-202ENST00000541086 2269 ntTSL 223.82■■□□□ 1.42e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 223.6■■□□□ 1.372e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 222.79■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AMN-203ENST00000558590 2772 ntTSL 220.06■□□□□ 0.82e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 219.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 28.38□□□□□ -1.072e-11■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 219.62■□□□□ 0.739e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-211ENST00000598707 882 ntTSL 218.99■□□□□ 0.639e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 316.13■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-216ENST00000601778 799 ntTSL 515.85■□□□□ 0.139e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 314.2□□□□□ -0.149e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.169e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-204ENST00000595470 560 ntTSL 213.93□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.279e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 ECH1-210ENST00000598316 553 ntTSL 212.73□□□□□ -0.379e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 58.83□□□□□ -19e-10■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-211ENST00000567987 1926 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-205ENST00000562441 1412 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-208ENST00000567065 883 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-203ENST00000540562 3064 ntTSL 214.05□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-213ENST00000569957 4469 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 310.75□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 59.4
PCBP1Q15365 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-10■■■■■ 59.3
PCBP1Q15365 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 217.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 37.29□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 59
PCBP1Q15365 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.093e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-207ENST00000446339 566 ntTSL 318.05■□□□□ 0.483e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-208ENST00000455060 934 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 ABHD4-204ENST00000489928 507 ntTSL 313.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-10■■■■■ 58.2
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