RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568924.1

ANKRD11-216, Transcript of ankyrin repeat domain 11, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD11, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD11-216ENST00000568924 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.24■■■□□ 2.91
ANKRD11-216ENST00000568924 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.51■■■□□ 2.31
ANKRD11-216ENST00000568924 ABCC9O60706 1549 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD11-216ENST00000568924 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
ANKRD11-216ENST00000568924 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD11-216ENST00000568924 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD11-216ENST00000568924 NACADO15069 1562 aa27.6■■■□□ 2.01
ANKRD11-216ENST00000568924 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD11-216ENST00000568924 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD11-216ENST00000568924 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.88■■□□□ 1.89
ANKRD11-216ENST00000568924 SCRIBQ14160 1630 aa26.8■■□□□ 1.88
ANKRD11-216ENST00000568924 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.63■■□□□ 1.85
ANKRD11-216ENST00000568924 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.56■■□□□ 1.84
ANKRD11-216ENST00000568924 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
ANKRD11-216ENST00000568924 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ANKRD11-216ENST00000568924 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ANKRD11-216ENST00000568924 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.76■■□□□ 1.71
ANKRD11-216ENST00000568924 SMARCA4P51532 1647 aa25.74■■□□□ 1.71
ANKRD11-216ENST00000568924 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.69■■□□□ 1.7
ANKRD11-216ENST00000568924 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD11-216ENST00000568924 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD11-216ENST00000568924 SMARCA2P51531 1590 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD11-216ENST00000568924 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD11-216ENST00000568924 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD11-216ENST00000568924 NCAPD3P42695 1498 aa25.42■■□□□ 1.66
ANKRD11-216ENST00000568924 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD11-216ENST00000568924 HMGXB3Q12766 1538 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD11-216ENST00000568924 WIZO95785 1651 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD11-216ENST00000568924 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ANKRD11-216ENST00000568924 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ANKRD11-216ENST00000568924 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ANKRD11-216ENST00000568924 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD11-216ENST00000568924 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD11-216ENST00000568924 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD11-216ENST00000568924 CFTRP13569 1480 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD11-216ENST00000568924 NESP48681 1621 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD11-216ENST00000568924 PRDM2Q13029 1718 aa24.58■■□□□ 1.52
ANKRD11-216ENST00000568924 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD11-216ENST00000568924 ERCC6Q03468 1493 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD11-216ENST00000568924 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD11-216ENST00000568924 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD11-216ENST00000568924 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD11-216ENST00000568924 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ANKRD11-216ENST00000568924 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD11-216ENST00000568924 WDR62O43379 1518 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD11-216ENST00000568924 ABCC8Q09428 1581 aa24.14■■□□□ 1.45
ANKRD11-216ENST00000568924 CUX2O14529 1486 aa24.11■■□□□ 1.45
ANKRD11-216ENST00000568924 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD11-216ENST00000568924 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD11-216ENST00000568924 TOPBP1Q92547 1522 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD11-216ENST00000568924 CUX1P39880 1505 aa23.99■■□□□ 1.43
ANKRD11-216ENST00000568924 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
ANKRD11-216ENST00000568924 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD11-216ENST00000568924 TOP2BQ02880 1626 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD11-216ENST00000568924 SYNJ1O43426 1573 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD11-216ENST00000568924 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD11-216ENST00000568924 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD11-216ENST00000568924 IFT140Q96RY7 1462 aa23.83■■□□□ 1.41
ANKRD11-216ENST00000568924 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
ANKRD11-216ENST00000568924 WDR97A6NE52 1622 aa23.74■■□□□ 1.39
ANKRD11-216ENST00000568924 SOGA1O94964 1423 aa23.73■■□□□ 1.39
ANKRD11-216ENST00000568924 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.69■■□□□ 1.38
ANKRD11-216ENST00000568924 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.68■■□□□ 1.38
ANKRD11-216ENST00000568924 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ANKRD11-216ENST00000568924 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ANKRD11-216ENST00000568924 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.58■■□□□ 1.36
ANKRD11-216ENST00000568924 TRIM41Q8WV44 630 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD11-216ENST00000568924 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD11-216ENST00000568924 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD11-216ENST00000568924 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD11-216ENST00000568924 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.352e-10■■■□□ 17.9
ANKRD11-216ENST00000568924 PBRM1Q86U86 1689 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD11-216ENST00000568924 KIF27Q86VH2 1401 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD11-216ENST00000568924 GRIN2BQ13224 1484 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD11-216ENST00000568924 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD11-216ENST00000568924 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD11-216ENST00000568924 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD11-216ENST00000568924 EEA1Q15075 1411 aa23.33■■□□□ 1.32
ANKRD11-216ENST00000568924 CUL7Q14999 1698 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD11-216ENST00000568924 ADAMTS12P58397 1594 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD11-216ENST00000568924 SYNJ2O15056 1496 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD11-216ENST00000568924 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD11-216ENST00000568924 IGF1RP08069 1367 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD11-216ENST00000568924 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD11-216ENST00000568924 CHD1O14646 1710 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD11-216ENST00000568924 GRIN2AQ12879 1464 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD11-216ENST00000568924 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD11-216ENST00000568924 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD11-216ENST00000568924 PRXQ9BXM0 1461 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD11-216ENST00000568924 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD11-216ENST00000568924 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD11-216ENST00000568924 FBLN2P98095 1184 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD11-216ENST00000568924 NUP160Q12769 1436 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD11-216ENST00000568924 KIF21BO75037 1637 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD11-216ENST00000568924 OSCARQ8IYS5 282 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD11-216ENST00000568924 CEP170Q5SW79 1584 aa23.02■■□□□ 1.28
ANKRD11-216ENST00000568924 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.02■■□□□ 1.28
ANKRD11-216ENST00000568924 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ANKRD11-216ENST00000568924 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD11-216ENST00000568924 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms