RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.08■■■■■ 4.49
INO80E-211ENST00000567987 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.61■■■■□ 3.61
INO80E-211ENST00000567987 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
INO80E-211ENST00000567987 ABCC9O60706 1549 aa35.81■■■■□ 3.32
INO80E-211ENST00000567987 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.73■■■■□ 3.31
INO80E-211ENST00000567987 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.58■■■■□ 3.29
INO80E-211ENST00000567987 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.22■■■■□ 3.23
INO80E-211ENST00000567987 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.1■■■■□ 3.21
INO80E-211ENST00000567987 NACADO15069 1562 aa35.09■■■■□ 3.21
INO80E-211ENST00000567987 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.84■■■■□ 3.17
INO80E-211ENST00000567987 SCRIBQ14160 1630 aa34.63■■■■□ 3.13
INO80E-211ENST00000567987 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.17■■■■□ 3.06
INO80E-211ENST00000567987 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.82■■■■□ 3
INO80E-211ENST00000567987 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.76■■■□□ 2.991e-6■■■□□ 19
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INO80E-211ENST00000567987 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.53■■■□□ 2.96
INO80E-211ENST00000567987 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
INO80E-211ENST00000567987 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.3■■■□□ 2.92
INO80E-211ENST00000567987 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
INO80E-211ENST00000567987 SMARCA4P51532 1647 aa33.16■■■□□ 2.9
INO80E-211ENST00000567987 WIZO95785 1651 aa33.03■■■□□ 2.88
INO80E-211ENST00000567987 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
INO80E-211ENST00000567987 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.73■■■□□ 2.83
INO80E-211ENST00000567987 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.66■■■□□ 2.82
INO80E-211ENST00000567987 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
INO80E-211ENST00000567987 SMARCA2P51531 1590 aa32.62■■■□□ 2.81
INO80E-211ENST00000567987 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
INO80E-211ENST00000567987 NCAPD3P42695 1498 aa32.4■■■□□ 2.78
INO80E-211ENST00000567987 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.38■■■□□ 2.77
INO80E-211ENST00000567987 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.34■■■□□ 2.77
INO80E-211ENST00000567987 HMGXB3Q12766 1538 aa32.32■■■□□ 2.76
INO80E-211ENST00000567987 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.12■■■□□ 2.73
INO80E-211ENST00000567987 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.77■■■□□ 2.68
INO80E-211ENST00000567987 TRIM41Q8WV44 630 aa31.66■■■□□ 2.66
INO80E-211ENST00000567987 CFTRP13569 1480 aa31.64■■■□□ 2.66
INO80E-211ENST00000567987 ABCC8Q09428 1581 aa31.62■■■□□ 2.65
INO80E-211ENST00000567987 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.57■■■□□ 2.65
INO80E-211ENST00000567987 PRDM2Q13029 1718 aa31.45■■■□□ 2.62
INO80E-211ENST00000567987 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.62
INO80E-211ENST00000567987 NESP48681 1621 aa31.39■■■□□ 2.62
INO80E-211ENST00000567987 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.32■■■□□ 2.6
INO80E-211ENST00000567987 SYNJ1O43426 1573 aa31.3■■■□□ 2.6
INO80E-211ENST00000567987 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.23■■■□□ 2.59
INO80E-211ENST00000567987 TOP2BQ02880 1626 aa31.17■■■□□ 2.58
INO80E-211ENST00000567987 CUX1P39880 1505 aa31.14■■■□□ 2.58
INO80E-211ENST00000567987 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.13■■■□□ 2.57
INO80E-211ENST00000567987 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
INO80E-211ENST00000567987 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.09■■■□□ 2.57
INO80E-211ENST00000567987 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.04■■■□□ 2.56
INO80E-211ENST00000567987 SOGA1O94964 1423 aa30.99■■■□□ 2.55
INO80E-211ENST00000567987 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.99■■■□□ 2.55
INO80E-211ENST00000567987 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.93■■■□□ 2.54
INO80E-211ENST00000567987 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.9■■■□□ 2.54
INO80E-211ENST00000567987 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.9■■■□□ 2.54
INO80E-211ENST00000567987 TOPBP1Q92547 1522 aa30.87■■■□□ 2.53
INO80E-211ENST00000567987 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
INO80E-211ENST00000567987 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.83■■■□□ 2.53
INO80E-211ENST00000567987 EEA1Q15075 1411 aa30.83■■■□□ 2.53
INO80E-211ENST00000567987 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.74■■■□□ 2.51
INO80E-211ENST00000567987 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.72■■■□□ 2.51
INO80E-211ENST00000567987 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
INO80E-211ENST00000567987 ERCC6Q03468 1493 aa30.7■■■□□ 2.51
INO80E-211ENST00000567987 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.7■■■□□ 2.51
INO80E-211ENST00000567987 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80E-211ENST00000567987 KIF27Q86VH2 1401 aa30.63■■■□□ 2.49
INO80E-211ENST00000567987 CUX2O14529 1486 aa30.61■■■□□ 2.49
INO80E-211ENST00000567987 WDR62O43379 1518 aa30.55■■■□□ 2.48
INO80E-211ENST00000567987 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.53■■■□□ 2.48
INO80E-211ENST00000567987 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
INO80E-211ENST00000567987 KIF21BO75037 1637 aa30.45■■■□□ 2.47
INO80E-211ENST00000567987 WDR97A6NE52 1622 aa30.45■■■□□ 2.46
INO80E-211ENST00000567987 GOLGA3Q08378 1498 aa30.42■■■□□ 2.46
INO80E-211ENST00000567987 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
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INO80E-211ENST00000567987 PRXQ9BXM0 1461 aa30.37■■■□□ 2.45
INO80E-211ENST00000567987 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
INO80E-211ENST00000567987 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.36■■■□□ 2.45
INO80E-211ENST00000567987 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
INO80E-211ENST00000567987 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.3■■■□□ 2.44
INO80E-211ENST00000567987 IFT140Q96RY7 1462 aa30.3■■■□□ 2.44
INO80E-211ENST00000567987 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.3■■■□□ 2.44
INO80E-211ENST00000567987 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.28■■■□□ 2.44
INO80E-211ENST00000567987 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.27■■■□□ 2.44
INO80E-211ENST00000567987 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.24■■■□□ 2.43
INO80E-211ENST00000567987 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.421e-7■■■■■ 40.7
INO80E-211ENST00000567987 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
INO80E-211ENST00000567987 CEP162Q5TB80 1403 aa30.14■■■□□ 2.42
INO80E-211ENST00000567987 CUL7Q14999 1698 aa30.14■■■□□ 2.42
INO80E-211ENST00000567987 PBRM1Q86U86 1689 aa30.1■■■□□ 2.41
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INO80E-211ENST00000567987 CLIP1P30622 1438 aa29.95■■■□□ 2.39
INO80E-211ENST00000567987 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.93■■■□□ 2.38
INO80E-211ENST00000567987 ADAMTS12P58397 1594 aa29.92■■■□□ 2.38
INO80E-211ENST00000567987 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.89■■■□□ 2.37
INO80E-211ENST00000567987 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
INO80E-211ENST00000567987 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.79■■■□□ 2.36
INO80E-211ENST00000567987 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.71■■■□□ 2.35
INO80E-211ENST00000567987 SYNJ2O15056 1496 aa29.7■■■□□ 2.35
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