Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HARS-206ENST00000502888 631 ntTSL 210.57□□□□□ -0.723e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-212ENST00000550880 595 ntTSL 210.24□□□□□ -0.773e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-201ENST00000243040 564 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.773e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-206ENST00000548984 541 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-213ENST00000550964 596 ntTSL 29.58□□□□□ -0.883e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-218ENST00000552742 571 ntTSL 39.45□□□□□ -0.93e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.13e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.233e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.233e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 ZC3H15-202ENST00000421536 1101 ntTSL 27.22□□□□□ -1.253e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-217ENST00000552548 497 ntTSL 27.12□□□□□ -1.273e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-219ENST00000553171 484 ntTSL 1 (best)5.11□□□□□ -1.593e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 TRIM28-215ENST00000601150 915 ntTSL 316.17■□□□□ 0.181e-27■■■■■ 82.8
EFTUD2Q15029 TRIM28-212ENST00000597995 702 ntTSL 211.64□□□□□ -0.551e-27■■■■■ 82.8
EFTUD2Q15029 LRRC45-206ENST00000583383 840 ntTSL 323.25■■□□□ 1.319e-16■■■■■ 82.2
EFTUD2Q15029 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.119e-16■■■■■ 82.2
EFTUD2Q15029 LRRC45-202ENST00000577638 730 ntTSL 215.97■□□□□ 0.159e-16■■■■■ 82.2
EFTUD2Q15029 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 80.4
EFTUD2Q15029 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 80.4
EFTUD2Q15029 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 80.4
EFTUD2Q15029 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 CD55-209ENST00000488171 1389 ntTSL 318.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 CD55-202ENST00000343420 978 ntTSL 515.88■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 80.3
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 322.64■■□□□ 1.214e-50■■■■■ 80.1
EFTUD2Q15029 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 54.15□□□□□ -1.754e-12■■■■■ 80.1
EFTUD2Q15029 RHEB-206ENST00000482053 557 ntTSL 33.13□□□□□ -1.914e-12■■■■■ 80.1
EFTUD2Q15029 PRPF40A-207ENST00000471701 293 ntTSL 22.75□□□□□ -1.975e-13■■■■■ 80.1
EFTUD2Q15029 ADD1-227ENST00000541051 975 ntTSL 212.2□□□□□ -0.464e-11■■■■■ 79.8
EFTUD2Q15029 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.383e-14■■■■■ 79.4
EFTUD2Q15029 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.213e-14■■■■■ 79.4
EFTUD2Q15029 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.349e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.39e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.269e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-212ENST00000490778 694 ntTSL 522.47■■□□□ 1.199e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-204ENST00000455123 1515 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.189e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-207ENST00000469716 573 ntTSL 322.38■■□□□ 1.179e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-209ENST00000471883 451 ntTSL 320.85■□□□□ 0.939e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-208ENST00000469926 645 ntTSL 319.78■□□□□ 0.769e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.369e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-214ENST00000493290 550 ntTSL 416.42■□□□□ 0.229e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-215ENST00000493469 579 ntTSL 216.42■□□□□ 0.229e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-213ENST00000491069 566 ntTSL 215.74■□□□□ 0.119e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-210ENST00000478801 555 ntTSL 47.7□□□□□ -1.189e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-216ENST00000632034 570 ntTSL 23.84□□□□□ -1.799e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-206ENST00000460873 569 ntTSL 43.76□□□□□ -1.819e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 PON2-203ENST00000446142 1099 ntTSL 1 (best)3.26□□□□□ -1.899e-13■■■■■ 79.3
EFTUD2Q15029 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-19■■■■■ 79.2
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EFTUD2Q15029 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-19■■■■■ 79.2
EFTUD2Q15029 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.663e-19■■■■■ 79.2
EFTUD2Q15029 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 39.91□□□□□ -0.823e-19■■■■■ 79.2
EFTUD2Q15029 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 29.91□□□□□ -0.823e-19■■■■■ 79.2
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-210ENST00000530623 569 ntTSL 420.74■□□□□ 0.916e-8■■■■■ 79.1
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-204ENST00000524934 466 ntTSL 313.33□□□□□ -0.286e-17■■■■■ 79.1
EFTUD2Q15029 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.556e-12■■■■■ 79
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EFTUD2Q15029 MARS-214ENST00000548714 567 ntTSL 219.2■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 78.5
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EFTUD2Q15029 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 78.5
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EFTUD2Q15029 SLC12A9-203ENST00000416675 840 ntTSL 518.17■□□□□ 0.52e-11■■■■■ 78.5
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EFTUD2Q15029 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 78.5
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EFTUD2Q15029 SLC12A9-206ENST00000448342 720 ntTSL 517.22■□□□□ 0.352e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 SLC12A9-209ENST00000467972 4433 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 SLC12A9-204ENST00000418037 916 ntTSL 316.4■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 78.5
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EFTUD2Q15029 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 POLD3-209ENST00000532784 575 ntTSL 414.94□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 SLC12A9-211ENST00000475687 4128 ntTSL 214.92□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-205ENST00000504769 548 ntTSL 414.85□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-206ENST00000504922 585 ntTSL 214.8□□□□□ -0.042e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 POLD3-206ENST00000530511 854 ntTSL 314.43□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 RERE-206ENST00000464367 639 ntTSL 313.37□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 FUBP3-205ENST00000487406 840 ntTSL 513.26□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-210ENST00000510087 590 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 SLC12A9-214ENST00000497958 840 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 LAMB2-216ENST00000494831 582 ntTSL 211.42□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 MARS-210ENST00000548146 558 ntTSL 411.18□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 POLD3-201ENST00000263681 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 SLC12A9-207ENST00000461016 262 ntTSL 58.29□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 38.01□□□□□ -1.132e-11■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 STIM2-208ENST00000478425 407 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 STIM2-201ENST00000463501 1072 ntTSL 35.96□□□□□ -1.462e-14■■■■■ 78.5
EFTUD2Q15029 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.462e-11■■■■■ 78.5
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3090.9 ms