RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488171.5

CD55-209, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 3

Gene CD55, Length 1,389 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-209ENST00000488171 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.13■■■■■ 5.3
CD55-209ENST00000488171 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.05■■■■■ 4.48
CD55-209ENST00000488171 ABCC9O60706 1549 aa42.72■■■■■ 4.43
CD55-209ENST00000488171 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.81■■■■■ 4.12
CD55-209ENST00000488171 NACADO15069 1562 aa40.61■■■■■ 4.09
CD55-209ENST00000488171 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.4■■■■■ 4.06
CD55-209ENST00000488171 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.17■■■■■ 4.02
CD55-209ENST00000488171 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
CD55-209ENST00000488171 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.93■■■■□ 3.98
CD55-209ENST00000488171 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.82■■■■□ 3.96
CD55-209ENST00000488171 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
CD55-209ENST00000488171 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.78■■■■□ 3.96
CD55-209ENST00000488171 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.65■■■■□ 3.94
CD55-209ENST00000488171 SCRIBQ14160 1630 aa39.24■■■■□ 3.87
CD55-209ENST00000488171 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.12■■■■□ 3.85
CD55-209ENST00000488171 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.63■■■■□ 3.77
CD55-209ENST00000488171 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
CD55-209ENST00000488171 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.45■■■■□ 3.75
CD55-209ENST00000488171 NCAPD3P42695 1498 aa37.5■■■■□ 3.59
CD55-209ENST00000488171 SMARCA4P51532 1647 aa37.48■■■■□ 3.59
CD55-209ENST00000488171 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.42■■■■□ 3.58
CD55-209ENST00000488171 SMARCA2P51531 1590 aa37.33■■■■□ 3.57
CD55-209ENST00000488171 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.57
CD55-209ENST00000488171 HMGXB3Q12766 1538 aa37.25■■■■□ 3.55
CD55-209ENST00000488171 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.12■■■■□ 3.53
CD55-209ENST00000488171 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.1■■■■□ 3.53
CD55-209ENST00000488171 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
CD55-209ENST00000488171 ERCC6Q03468 1493 aa36.83■■■■□ 3.49
CD55-209ENST00000488171 NESP48681 1621 aa36.81■■■■□ 3.48
CD55-209ENST00000488171 CUX2O14529 1486 aa36.69■■■■□ 3.46
CD55-209ENST00000488171 WIZO95785 1651 aa36.66■■■■□ 3.46
CD55-209ENST00000488171 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.59■■■■□ 3.45
CD55-209ENST00000488171 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
CD55-209ENST00000488171 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CD55-209ENST00000488171 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.35■■■■□ 3.41
CD55-209ENST00000488171 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.35■■■■□ 3.41
CD55-209ENST00000488171 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.34■■■■□ 3.41
CD55-209ENST00000488171 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.29■■■■□ 3.4
CD55-209ENST00000488171 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CD55-209ENST00000488171 CFTRP13569 1480 aa36.03■■■■□ 3.36
CD55-209ENST00000488171 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.03■■■■□ 3.36
CD55-209ENST00000488171 WDR62O43379 1518 aa35.96■■■■□ 3.35
CD55-209ENST00000488171 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.95■■■■□ 3.35
CD55-209ENST00000488171 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.95■■■■□ 3.35
CD55-209ENST00000488171 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.8■■■■□ 3.32
CD55-209ENST00000488171 PRDM2Q13029 1718 aa35.7■■■■□ 3.31
CD55-209ENST00000488171 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CD55-209ENST00000488171 TOPBP1Q92547 1522 aa35.31■■■■□ 3.24
CD55-209ENST00000488171 ABCC8Q09428 1581 aa35.24■■■■□ 3.23
CD55-209ENST00000488171 IFT140Q96RY7 1462 aa35.22■■■■□ 3.23
CD55-209ENST00000488171 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.21■■■■□ 3.23
CD55-209ENST00000488171 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
CD55-209ENST00000488171 OSCARQ8IYS5 282 aa35.03■■■■□ 3.2
CD55-209ENST00000488171 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CD55-209ENST00000488171 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CD55-209ENST00000488171 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
CD55-209ENST00000488171 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
CD55-209ENST00000488171 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.173e-7■■■■■ 27
CD55-209ENST00000488171 CUX1P39880 1505 aa34.84■■■■□ 3.17
CD55-209ENST00000488171 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.84■■■■□ 3.17
CD55-209ENST00000488171 TRIM41Q8WV44 630 aa34.8■■■■□ 3.16
CD55-209ENST00000488171 SOGA1O94964 1423 aa34.8■■■■□ 3.16
CD55-209ENST00000488171 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.79■■■■□ 3.16
CD55-209ENST00000488171 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CD55-209ENST00000488171 CHD1O14646 1710 aa34.65■■■■□ 3.14
CD55-209ENST00000488171 WDR97A6NE52 1622 aa34.64■■■■□ 3.14
CD55-209ENST00000488171 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.6■■■■□ 3.13
CD55-209ENST00000488171 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.6■■■■□ 3.13
CD55-209ENST00000488171 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.6■■■■□ 3.13
CD55-209ENST00000488171 FBLN2P98095 1184 aa34.52■■■■□ 3.12
CD55-209ENST00000488171 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.52■■■■□ 3.12
CD55-209ENST00000488171 ARHGEF11O15085 1522 aa34.51■■■■□ 3.11
CD55-209ENST00000488171 GRIN2BQ13224 1484 aa34.47■■■■□ 3.11
CD55-209ENST00000488171 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CD55-209ENST00000488171 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.42■■■■□ 3.1
CD55-209ENST00000488171 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.39■■■■□ 3.1
CD55-209ENST00000488171 PBRM1Q86U86 1689 aa34.37■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.36■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.36■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 TOP2BQ02880 1626 aa34.36■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 SYNJ1O43426 1573 aa34.33■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CD55-209ENST00000488171 SYNJ2O15056 1496 aa34.32■■■■□ 3.08
CD55-209ENST00000488171 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.28■■■■□ 3.08
CD55-209ENST00000488171 ARAP1Q96P48 1450 aa34.2■■■■□ 3.07
CD55-209ENST00000488171 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.2■■■■□ 3.07
CD55-209ENST00000488171 ADAMTS12P58397 1594 aa34.07■■■■□ 3.04
CD55-209ENST00000488171 GRIN2AQ12879 1464 aa34.03■■■■□ 3.04
CD55-209ENST00000488171 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34■■■■□ 3.03
CD55-209ENST00000488171 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.97■■■■□ 3.03
CD55-209ENST00000488171 NUP160Q12769 1436 aa33.92■■■■□ 3.02
CD55-209ENST00000488171 CEP170Q5SW79 1584 aa33.91■■■■□ 3.02
CD55-209ENST00000488171 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.78■■■■□ 3
CD55-209ENST00000488171 SHROOM2Q13796 1616 aa33.74■■■□□ 2.99
CD55-209ENST00000488171 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
CD55-209ENST00000488171 KIF27Q86VH2 1401 aa33.66■■■□□ 2.98
CD55-209ENST00000488171 IGF1RP08069 1367 aa33.63■■■□□ 2.97
CD55-209ENST00000488171 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.58■■■□□ 2.97
CD55-209ENST00000488171 CUL7Q14999 1698 aa33.56■■■□□ 2.96
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